摘要
通过检索中国知网(CNKI)和国际性综合生物医学信息书目数据库(Medline)构建家蚕的功效成分数据集,运用网络药理学技术筛选家蚕活性成分靶点和疾病靶点,并且对核心靶点进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)和基因本体(GO)富集分析。
家蚕抗2型糖尿病功效成分对应核心靶点30个,涉及63条相关信号通路,其中显著富集在癌症通路、ErbB信号通路、HIF-1信号通路、胰岛素抵抗、FoxO信号通路、非酒精性脂肪肝(NAFLD)等信号通路。
家蚕(幼虫)的药用价值一直受到人们的重视,古代医籍《中华本草》《本草纲目》均记载家蚕体入药可止消渴(糖尿病),现代医药学也进一步证明了家蚕幼虫体具有保肝、提高免疫、降血糖、降血脂等多种功效。但目前关于家蚕抗2型糖尿病(T2DM)的作用机制研究并不充分。因此,本研究通过网络药理学对家蚕活性成分抗T2DM的潜在靶点和分子机制进行解析,为更全面地研究家蚕抗T2DM的作用机制指明方向。
中国知网(https://www.cnki.net/);Medline数据库(https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/);TCMSP数据库(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php);PubChem数据库(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/);Swiss Target Prediction数据库(http://www.swisstargetprediction.ch/);Gene Card数据库(https://www.genecards.org/);在线韦恩图(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html);STRING数据库(https://string-db.org/);DAVID 6.8数据库(https://david.ncifcrf.gov/);Cytoscape 3.8.0软件。
通过查阅文献对家蚕中的主要活性成分进行归类,建立家蚕活性成分集。通过检索PubChem、Swiss Target Prediction和Gene Card数据库获取家蚕活性成分与T2DM对应的靶标。
将家蚕活性成分抗T2DM的潜在靶点导入Cytoscape 3.8.0软件中,根据点度中心值(degree)、接近中心值(closeness)和中介中心值(betweenness)筛选TOP 30个靶点作为家蚕活性成分抗T2DM的核心靶点并进行可视化展示。
现有文献检索结
通过PubChem、Swiss Target Prediction和Gene Card数据库获得T2DM对应靶标12272个,氨基酸对应靶点19400个,脂肪酸对应靶点1067个,生物碱对应靶点3822个,维生素对应靶点7832个,黄酮类对应靶点714个。161个交集靶点则为家蚕活性成分抗T2DM的潜在靶点。见

图1 家蚕活性成分与T2DM的靶基因映射
将161个潜在靶点上传至STRING数据库进行蛋白互作分析。PPI结果显示家蚕活性成分抗T2DM功效PPI网络节点161个,平均度值7.25,584条边,P<1.0e-16。见

图2 潜在靶点PPI网络
对家蚕活性成分抗T2DM的30个核心靶点进行GO富集分析。根据P<0.01,筛选得出家蚕活性成分抗T2DM核心靶点显著富集的生物过程(BP)、细胞组分(CC)、分子功能(MF)分别为39条、6条和16条,其中P值最小的Top 10条生物过程(BP)、细胞组分(CC)、分子功能(MF)见

图3 核心靶点GO富集分析

图4 药物-成分-疾病-核心靶点-通路网络图
家蚕作为一种经济资源昆虫,其药用价值一直受到人们的重视,古代医籍《中华本草》《本草纲目》中均有家蚕体入药可治疗糖尿病的相关记
氨基酸和维生素是机体进行正常生理活动所必需的物质,根据既往研究发现,氨基酸代谢异常与T2DM的发生密切相关。张志军
亚麻酸和亚油酸为人体必需脂肪酸,对维持机体正常生命活动起着至关重要的作用。α-亚麻酸为ω-3系列多不饱和脂肪酸,具有显著的药理作用和营养价值。从食物中获取的α-亚麻酸可在体内合成一系列代谢产物,其中最重要的是具有调节血脂、抗炎、抗氧化、提高免疫力等生理活性的二十碳五烯酸(EPA)和二十二碳六烯酸(DHA
黄酮类化合物主要通过清除机体自由基,调节脂质代谢紊乱,减少炎症反应,进而改善T2DM,是具有极高应用价值的天然活性产物。生物碱类主要通过调节胰岛素信号通路相关蛋白的表达,提高外周组织对胰岛素的敏感性,减少氧化应激以及胰岛素抵抗等参与糖尿病的发展进
综上,本研究通过网络药理学技术阐释了家蚕可通过多成分-多靶点-多途径调控机制改善T2DM。
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