目的 基于转录组学探讨益肾降浊汤（YSJZT）治疗环孢素A（cyclosporine A，CsA）诱导人近端肾小管上皮细胞（Human kidney-2，HK-2）损伤的作用机制。方法 采用CCK-8法检测HK-2细胞活力。HK-2细胞分为正常对照组（NC组）、模型组（C组）和治疗组（T组）。C组加入含CsA 16.8 μmol/L的培养基干预24 h后换常规培养基继续培养24 h；T组加入含YSJZT 0.5 mg/mL的培养基干预48 h，造模同C组。干预完成后提取各组细胞总RNA，进行转录组测序检测差异表达基因（differentially expressed gene，DEG）。对交集的DEG进行GO功能显著性富集和KEGG通路显著性富集分析。结果 益肾降浊汤可回调环孢素A诱导的HK-2细胞活性下降；C组与NC组比较得到显著DEG 1410个；T组与C组比较得到显著DEG 127个；交集得到的66个DEG通过GO功能富集，主要集中在分子功能部分的粒细胞巨噬细胞集落刺激因子受体绑定、雌激素酮磺基转移酶活性，生物学过程部分的雌激素代谢过程、表皮生长因子受体信号通路；KEGG通路富集主要在Fc epsilon RI信号通路、T细胞受体信号通路、甾类激素生物合成通路、ErbB信号通路；主要涉及集落刺激因子2（Csf 2）、磺基转移酶1E家族成员1（Sult1E1）、上皮调节蛋白（EREG）等基因。结论 益肾降浊汤通过多靶点恢复环孢素A诱导HK-2细胞损伤的细胞活力，其中调控Csf 2、Sult1E1、EREG多个靶基因及其相关信号通路，可能是其减轻CsA肾毒性的作用机制。